L’établissement est géré par une association (loi 1901) l’OGEC ENSTA (Organisme de gestion de l’école catholique Ecole Nouvelle Saint Thomas d’Aquin) composé par des parents d’élèves bénévoles.

Le bureau est composé d’un président, d’un trésorier et d’un secrétaire. C’est une instance essentielle pour le bon fonctionnement de l’établissement.

Ses membres travaillent en lien avec la direction de l’école. Cela permet de prendre des décisions d’investissement qui sont au plus près des besoins des enfants : travaux et investissements pédagogiques.